Las complicaciones y problemáticas del Síndrome de Werner son muy frecuentes y de mayor gravedad en edades mucho más avanzadas de la vida: osteoporosis, mayor probabilidad de aparición de quistes y tumores cancerosos (especialmente sarcomas y melanomas), problemas cardíacos, diabetes tipo 2, alteraciones endocrinas, disminución de la libido y alteraciones neurológicas.
Lamentablemente el envejecimiento generado por este trastorno suele conllevar una notable disminución en la esperanza de vida, siendo la media de supervivencia inferior a los cincuenta años de edad. Algunas de las causas de muerte más comunes son los problemas cardiovasculares o la aparición de sarcomas u otros tipos de cáncer.
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